至此，賊首或被殺、或被擒。
夏侯惇這才領兵入城，開始清理戰場，救滅遺火，儘收五家宗族的老小，使人飛報曹操。
曹操傳令，命夏侯惇將耿、韋二人，及五家宗族老小，皆斬於市，並將在朝大小百官，儘行拿解鄴郡，聽候發落。
次日，夏侯惇儘殺五家宗族老小，強行押解百官赴鄴郡，等待曹操發落。
數日後，曹操在教場之上，左立紅旗，右立白旗，象征著生與死的抉擇。
他冷聲下令：“耿紀、韋晃等人叛逆作亂，放火燒毀了許都。你們之中，有救火者，亦有閉門不出者。現在，曾救火者，立於紅旗下；如不曾救火者，立於白旗下。”
眾官們心中忐忑不安，自思救火者必無罪，於是多奔紅旗之下。
在這四百多名官員之中，隻有不到一百人立於白旗下，其餘人皆立於紅旗之下。
曹操瞥了一眼這些紅旗下的人們，眼中閃過一絲狠厲。
他揮手示意，下令將紅旗下的人全部拿下。
這一突如其來的命令，讓在場的眾官們驚愕不已，而立於紅旗之下的官員們，更是紛紛辯解，聲稱自己無罪。
曹操卻不為所動，他淡淡地說道：“你們當時的心，並非真正為了救火，而是想要幫助那些逆賊。”
這句話如同重錘一般，狠狠地擊在了那些紅旗下的人的心頭。
曹操沒有給他們任何求生的機會，他下令將這些人都牽到漳河邊斬首示眾，死者多達三百餘人。
而那些選擇立於白旗下的人，則得到了曹操的賞賜，並被允許返回許都。